Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pole3Q9JKP7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms