Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
AtrQ9JKK8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
AtrQ9JKK8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms