Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cyp39a1Q9JKJ9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms