Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trem1Q9JKE2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trem1Q9JKE2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms