Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Scamp5Q9JKD3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms