Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Alyref2Q9JJW6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Alyref2Q9JJW6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Alyref2Q9JJW6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Alyref2Q9JJW6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Alyref2Q9JJW6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Alyref2Q9JJW6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Alyref2Q9JJW6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Alyref2Q9JJW6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Alyref2Q9JJW6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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