Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Efcc1Q9JJF6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms