Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod3Q9JHJ0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Tmod3Q9JHJ0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Tmod3Q9JHJ0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Tmod3Q9JHJ0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Tmod3Q9JHJ0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Tmod3Q9JHJ0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Tmod3Q9JHJ0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Tmod3Q9JHJ0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Tmod3Q9JHJ0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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