Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rb1cc1Q9ESK9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms