Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Usp29Q9ES63 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Usp29Q9ES63 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Usp29Q9ES63 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Usp29Q9ES63 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp29Q9ES63 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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