Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trhr2Q9ERT2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trhr2Q9ERT2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms