Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slco1c1Q9ERB5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms