Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Clstn2Q9ER65 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clstn2Q9ER65 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms