Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stx12Q9ER00 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms