Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp1aQ9EPL5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp1aQ9EPL5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms