Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnft1Q9DCN7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms