Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Csnk1dQ9DC28 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Csnk1dQ9DC28 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Csnk1dQ9DC28 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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Csnk1dQ9DC28 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Csnk1dQ9DC28 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Csnk1dQ9DC28 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1dQ9DC28 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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