Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Ms4a4b-201ENSMUST00000035258 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Riok3Q9DBU3 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Riok3Q9DBU3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms