Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Med27Q9DB40 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Med27Q9DB40 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms