Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pop5Q9DB28 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pop5Q9DB28 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pop5Q9DB28 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Pop5Q9DB28 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Pop5Q9DB28 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pop5Q9DB28 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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