Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rhobtb1Q9DAK3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb1Q9DAK3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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