Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmbim4Q9DA39 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms