Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms