Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actrt1Q9D9J3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Actrt1Q9D9J3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms