Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9G2

Pebp4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pebp4Q9D9G2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pebp4Q9D9G2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pebp4Q9D9G2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pebp4Q9D9G2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pebp4Q9D9G2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pebp4Q9D9G2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pebp4Q9D9G2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pebp4Q9D9G2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pebp4Q9D9G2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pebp4Q9D9G2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms