Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cntd1Q9D995 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cntd1Q9D995 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms