Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rexo2Q9D8S4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rexo2Q9D8S4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms