Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rpl4Q9D8E6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl4Q9D8E6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms