Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Chmp4bQ9D8B3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chmp4bQ9D8B3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms