Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Klhl40Q9D783 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms