Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc94Q9D6J3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms