Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J1

Cers4, Ceramide synthase 4, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers4Q9D6J1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers4Q9D6J1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers4Q9D6J1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers4Q9D6J1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cers4Q9D6J1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cers4Q9D6J1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cers4Q9D6J1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms