Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cmtm5Q9D6G9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cmtm5Q9D6G9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms