Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra4Q9D6F4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra4Q9D6F4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms