Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4f1Q9D5Q6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms