Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3a3Q9D554 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms