Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc130Q9D516 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms