Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
4930556J24RikQ9D4U7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms