Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf6Q9D4J7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Phf6Q9D4J7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms