Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gcc1Q9D4H2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gcc1Q9D4H2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms