Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efhc2Q9D485 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Efhc2Q9D485 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms