Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pus10Q9D3U0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pus10Q9D3U0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms