Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Snrnp35Q9D384 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms