Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Krt20Q9D312 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms