Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx20Q9D2Y5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snx20Q9D2Y5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms