Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9D2Q3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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