Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Trim42Q9D2H5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim42Q9D2H5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms