Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pramef12Q9D2F1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pramef12Q9D2F1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms