Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Snapc3Q9D2C9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snapc3Q9D2C9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms