Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Creb3l4Q9D2A5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Creb3l4Q9D2A5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Creb3l4Q9D2A5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Creb3l4Q9D2A5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Creb3l4Q9D2A5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Creb3l4Q9D2A5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms